Het programma A1-zone heeft zes partners: Ministeries van Verkeer en Waterstaat en VROM, de provincies Gelderland en Overijssel en de regio's Stedendriehoek en Twente. Alle partijen zijn vertegenwoordigd in de Begeleidingsgroep en de Stuurgroep. Ook andere belanghebbenden, zoals ondernemers en maatschappelijke groeperingen worden betrokken bij het proces. Zij hebben echter geen plek in de programmaorganisatie.